Titre : RECONSTRUCTION DES RÉSEAUX D’INTERACTIONS ENTRE LES PLANTES, XYLELLA FASTIDIOSA WELLS et al., ET SES VECTEURS POTENTIELS À L’AIDE D’OUTILS DE SÉQUENÇAGE À HAUT DÉBIT : INTÉRÊT POUR LE CONTRȎLE DE LA MALADIE
Title : DECIPHERING THE NETWORK OF INTERACTION BETWEEN XYLELLA FASTIDIOSA, ITS HOST PLANTS AND POTENTIAL INSECT VECTORS USING NEXT GENERATION SEQUENCING METHODS: INTEREST FOR THE MANAGEMENT OF THE DISEASE
Auteur(s) : J.-Y. RASPLUS, J.-C. STREITO, J.-P. ROSSI, G. GENSON (INRA Montpellier), J.-F. GERMAIN (ANSES),M. GODEFROID, A.-A. GONZALEZ, S. NIDELET, É. PIERRE (INRA Montpellier), S. PUISSANT (Muséum - Jardin des Sciences), S. SANTONI, A. CRUAUD (INRA Montpellier)
Evénement : JEVI
Numéro : 4
Année : 2016
Numéro de page : 47
Nombre de pages : 9
Résumé : La détection récente de deux sous-espèces de Xylella fastidiosa (Xf) en Europe (ssp. pauca et multiplex) met l’agriculture européenne face à un défi de grande ampleur : trouver des méthodes de lutte efficaces pour gérer une maladie économiquement redoutable. En effet, un contrôle de la maladie ciblé sur une plante cultivée en particulier serait voué à l’échec du fait du large spectre de plantes-hôtes. De même, le contrôle d’un seul vecteur – même important – pourrait s’avérer inadéquat pour limiter la diffusion de la maladie. Enfin, les variations entre communautés « plantes – vecteurs » dues à des contextes géographiques et écologiques différents pourraient influencer la dynamique de transmission et potentiellement l’évolution de la virulence de la maladie. Pour ces raisons, une gestion efficace de Xf nécessite de mieux comprendre le contexte écologique gouvernant sa transmission. Il est donc nécessaire et urgent d’améliorer nos connaissances sur les plantes réservoirs et les vecteurs potentiels ainsi que sur la nature des interactions existants au sein de ces communautés. Le développement récent de nouvelles technologies de séquençage permet d’envisager de mieux décrire – à la fois qualitativement et quantitativement - les interactions complexes existant entre Xf, ses vecteurs et ses plantes-hôtes à l’interface entre milieux agricoles et habitats semi-naturels. Ces nouveaux outils permettent d’identifier les insectes porteurs de la maladie ainsi que les souches bactériennes impliquées, de décrire leur microbiome (qui peut influencer leurs traits d’histoire de vie), et de déterminer les plantes dont ils ont récemment absorbé les sèves. Nous présenterons les méthodes moléculaires haut-débit que nous développons pour décrire les interactions au sein des communautés « plantes – Xf – vecteurs ». Nous donnerons également un aperçu des premiers résultats obtenus et discuterons l’intérêt de ces méthodes pour mieux identifier les espèces (vecteurs ou plantes) ayant un rôle déterminant dans la propagation de la maladie au sein des agroécosystèmes.
Mots-clés : Xylella fastidiosa, insectes vecteurs, plantes-hôtes, interactions, NGS
Abstract : With the recent detection of two subspecies of Xylella fastidiosa (Xf) (ssp. pauca and multiplex), European agriculture faces a major challenge: find efficient methods to manage this serious disease. As Xf can contaminate multiple host plants, targeting a single plant species will be inefficient. Similarly, targeting a single species of insect vector would limit the efficiency of disease control measures. Finally, differences among plant/insect communities occurring in different ecological and geographical contexts may influence the spread and potentially also the virulence of the disease. Therefore, deciphering the network of interaction between Xf, its host plants, and potential insect vectors is crucial to set up efficient control measures. With next generation sequencing methods, it is now possible to simultaneously identify insects, their microbiome (that can influence their life history traits), the plants they fed on and the subspecies / strains of Xf they may carry. We will present the methods we are developing to describe plant-Xf-insect communities, give an overview of our first results and will discuss the interest of such methods to better identify plants or insects that may play a key role in the spread of the disease.
Keywords : Xylella fastidiosa, insect vectors, host plants, interaction, NG
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