Végéphyl s’est dotée de 13 commissions thématiques. Et c’est au sein de chaque commission que les experts échangent entre eux afin de contribuer à l’amélioration de la santé et de la protection des végétaux.
Ces commissions sont les suivantes :
- Commission l’Observatoire de la nuisibilité
- Commission des essais biologiques (CEB)
- Commission interprofessionnelle d’étude des techniques d’application de produits phytosanitaires (CIETAP)
- Comité de lutte contre les mauvaises herbes (COLUMA)
- Commission formation
- Commission jardins, espaces végétalisés et infrastructures (JEVI) (commission en sommeil)
- Commission maladies des plantes
- Commission moyens de protection pour une production intégrée (MPPI)
- Commission ravageurs et auxiliaires
- Commission réglementation
- Commission terminologie.