Titre : ÉVOLUTION DE LA RÉSISTANCE CHEZ L’AMBROISIE A FEUILLES D’ARMOISE (AMBROSIA ARTEMISIIFOLIA L.) : RECHERCHE DES DÉTERMINISMES GÉNÉTIQUES ET APPLICATION AU DIAGNOSTIC MOLÉCULAIRE
Title :
Auteur(s) : Ingvild Loubet, , Valérie Le Corre, Christophe Délye (UMR Agroécologie, INRAE-DIJON), Benoit Barrès (Université de Lyon, Anses, INRAE, USC CASPER
Evénement : COLUMA
Numéro : 25
Année : 2023
Numéro de page :
Nombre de pages : 10
Résumé : L’ambroisie à feuilles d’armoise (Ambrosia artemisiifolia L.) est une espèce adventice problématique majoritairement dans les cultures estivales (maïs, soja et tournesol). Son contrôle est cependant menacé par l’apparition de résistances aux inhibiteurs de l’ALS. Dans ce travail nous montrons la puissance des outils de séquençage de nouvelle génération permettant i) un diagnostic de la résistance rapide à l’échelle nationale ii) l’identification des déterminismes génétiques de la résistance non liée à la cible (RNLC). Le diagnostic de la résistance a montré une résistance émergente sur la majeure partie du territoire, les principaux cas étant liés à de la RNLC. Le séquençage du transcriptome de plantes de six populations a montré l’implication d’enzymes de détoxication dans ces mécanismes de RNLC. Également, il a révélé une diversité insoupçonnée de mécanismes de RNLC entre et au sein des diverses populations d’ambroisie étudiées.
Mots-clés : Ambroisie à feuilles d’armoise, résistance, ALS, diagnostic, séquençage haut-débit
Abstract : Common ragweed (Ambrosia artemisiifolia L.) is a troublesome weed in summer crops (corn, soybean and sunflower). However, its control is threatened by the emergence of resistance to ALS inhibitors. In this work, we demonstrate the power of next-generation sequencing tools for i) rapid resistance diagnosis at a national scale ii) identification of the genetic determinisms of non-target-site resistance (NTSR). Resistance diagnosis showed emerging resistance over most of the country, mainly due to NTSR. Transcriptome sequencing of plants from six populations showed the involvement of detoxification enzymes in these NTSR mechanisms. It also revealed an unsuspected diversity of NTSR mechanisms between and within the various ragweed populations studied.
Keywords : common ragweed, herbicide resistance, ALS, diagnostic, high throughput sequencing
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