Titre : Résistance de Plasmopara viticola aux inhibiteurs du complexe III : Un point sur la caractérisation phénotypique et génotypique des souches
Title : HYPERSPECTRAL IMAGING : IDENTIFICATION OF SPECIFIC WAVELENGTHS TO QUANTIFY FUSARIUM HEAD BLIGHT ON SOFT WHEAT
Auteur(s) : M. FAURE (GEVES), F. SERRE, S. ROCHE (INRA UE PHACC 1375), J.-P. MAIGNIEL (GEVES), C. SAINTENAC (INRA UMR 1095 GDEC), V. CADOT (GEVES)
Evénement : CIMA
Numéro : 12
Année : 2018
Numéro de page : 360
Nombre de pages : 11
Résumé : Un des objectifs du projet Ecophyto IRIGAM est de développer une méthode de phénotypage plus rapide et objective que les notations visuelles pour quantifier les symptômes de la fusariose de l’épi sur blé tendre, en utilisant l’imagerie spectrale. Des analyses chimiométriques d’images hyperspectrales (400nm-1000nm) ont permis d’identifier les longueurs d’ondes les plus pertinentes pour discriminer les épis sains des épis fusariés. A partir de données d’apprentissage acquises en 2016 et 2017, 4 sous-ensembles de 2 à 5 longueurs d’onde ont été validés sur 678 épis, provenant de 20 variétés implantées sur 2 sites. Le taux de surface fusariée sur épi, mesuré par analyse spectrale, est significativement corrélé avec les notations visuelles de référence (R²>0.86) pour des stades de développement des épis compris entre 300°C/j et 500°C/j après inoculation. Les facteurs année et environnement ne modifient pas les longueurs d‘ondes identifiées comme discriminantes.
Mots-clés : Fusariose des épis – Blé tendre – Imagerie Hyperspectrale – Sélection de longueurs d’ondes
Abstract : One of the objectives of the Ecophyto IRIGAM project is to develop a faster and more objective method than visual notations to quantify the symptoms of fusarium head blight on soft wheat using spectral imaging. Chemiometric analyses of hyperspectral images (400nm-1000nm) have enabled to identify the most revelent wavelengths to discriminate healthy ears of fusarium ears. From training data acquired in 2016 and 2017, 4 sets of 2 to 5 wavelengths were validated on 678 ears, coming from 20 varieties planted on 2 sites. The rate of fusarium surface on ear, measured by spectral analysis, is significantly correlated with visual reference notations (R²>0.86) whatever the stage of development of the ears between 300°C/d and 500°C/d after inoculation. The year and environment effect do not modify the wavelengths identified as discriminating, with high prediction rate of fusarium ears of R²>0.82 in 2017 from training data 2016 and R²>0.84 in 2016 from training data 2017.
Keywords : Fusarium Head Blight – Soft wheat – Hyperspectral imaging – Wavelengths selection
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